Cross Academy adalah sebuah sekolah elit dengan dua kelas yang terisolasi: Kelas Siang Hari dan Kelas Malam Hari. Di depan orang biasa, Yuuki Cross dan Zero Kiryuu adalah ketua siswa sekolah tersebut dan bertugas menjaga kestabilan antara para siswa ketika kelas memasuki sore hari. Kelas Malam penuh dengan siswa cantik dan tampan, hal ini terbukti membawa sedikit masalah. Hal itu sangat diperlukan, tetapi para siswa elit tersebut pada kenyataannya adalah vampire.
Subtitle: Indonesia Sinopsis: Vampire Knight Guilty merupakan season 2 dari anime Vampire Knight, Zero datang kembali setelah kepergiannya dari akademi. Meskipun Yuuki merasa lega namun masa lalunya masih diselimuti misteri, bertanya-tanya apa yang sebenarnya terjadi pada zero saat itu.
Yuuki dan Zero bertindak sebagai pelindung, melindungi rahasia Kelas Malam dan keamanan dari Kelas Siang yang tidak peduli.